海门位于长江入海口北侧，拥有海岸线11.73公里，江岸线50.5公里。随着苏通长江大桥、崇海长江大桥、崇启长江大桥、沪通铁路过江隧道等四条越江通道的建设，将和上海全方位、零距离接轨，并融入苏南立体交通网络。

　　跨江通道

　　苏通长江大桥

　　苏通长江大桥，是一座正在建设中的跨江斜拉桥，该工程于2003年5月开工，建成后将连通南通与苏州两市。预计该工程将于2007年底建成通车。海门市区距离苏通长江大桥8公里。届时，从海门市区到上海虹桥机场仅需1小时。

　　崇海长江大桥

　　崇海长江大桥是沪崇苏大通道建设中的重要一环。2003年2月，崇明越江隧道工程项目建议书获国务院批准立项。2004年12月28日，东线的上海长江隧道、上海长江大桥正式奠基启动。目前，崇海长江大桥建设已取得实质性进展，将于2007年底前立项，有望2008年开工建设。届时，从海门市区到上海浦东国际机场仅需1小时。

　　崇启长江大桥

　　崇启长江大桥也是沪崇苏大通道建设中的重要一环。该大桥已正式立项。海门市区距离崇启长江大桥40公里。

　　沪通铁路

　　沪通铁路穿越海门，并在海门设站，目前已通过国家立项，将于2008年动工兴建，2010年通车。建成后，从海门站到上海站仅需0.5小时。

　　越江汽渡

　　海太汽渡 海太汽渡(海门—太仓)被誉为“长江第一渡”，是目前南通地区通往上海最便捷的越江通道，过江时间为20-25分钟。

　　崇海汽渡 崇海汽渡(海门—崇明)位于我市海门港。通过崇海汽渡可抵达中国第三大岛、绿色生态岛——崇明岛。我市的海永乡就位于该岛。

　　港口

　　东灶港 海门拥有黄海岸线11.73公里，其中东灶港小庙洪水域有深水岸线3公里，可建18个3.5-5万吨级码头。港口建成后可作为上海洋山港的卫星港。

　　海门港 海门拥有长江岸线50.5公里，其中可直接利用的深水岸线6.8公里，可建5-10万吨级泊位10座。从海门港到南通港20公里，到上海吴淞港100公里，到上海洋山港120公里。

　　公路

　　形成了“两高速、六互通”及苏335线、苏336线、苏222线等省级公路网络。“两高速”即宁启高速公路和扬启高速公路。宁启高速公路横贯我市全境，从海门至南京不到3个小时；扬启高速公路斜穿我市北部，目前正在规划建设中。“六互通”即海门互通、悦来互通(已建)，宁启高速叠石桥互通(在建)，常乐互通、崇海大桥接线海门南互通，扬启高速包场互通(规划)。

　　空港

　　“三大机场”环抱海门：即南通兴东机场、上海虹桥机场和上海浦东国际机场。海门到南通兴东机场35公里，到上海虹桥机场100公里，到上海浦东国际机场120公里。

　　河运

　　海门内河纵横交错，水运便捷。通吕运河位于我市北侧，长28.2公里，通航能力为500吨；浒通河位于我市西侧，长17公里，通航能力为300吨；灵甸河位于我市东侧，长21.5公里，通航能力为300吨。